Selkäliiton ylin päättävä elin on liiton kokous. Kokouksia on kaksi vuodessa. Syyskokouksessa valitaan hallitus, vahvistetaan toimintasuunnitelma ja talousarvio. Kevätkokouksessa hyväksytään toimintakertomus ja tilinpäätös. Lisäksi kokouksissa voidaan käsitellä yhdistysten kokouksille esittämiä asioita.

Liiton jäsenyhdistykset valitsevat kokouksiin edustajansa suhteessa jäsenmääriinsä.

Hallitus

Hallitus vastaa Selkäliiton toiminnasta ja sen tuloksellisuudesta sekä valmistelee liiton kevät- ja syyskokouksissa käsiteltävät asiat.

Selkäliiton hallituksen jäsenet vuonna 2024

Rinne Marjo (puheenjohtaja), terveystieteiden tohtori, fysioterapeutti, erikoistutkija (eläkkeellä)
Autio Arvo, teknikko, työnjohtaja (eläkkeellä)
Frosterus Kaarina, järjestöaktiivi
Heikkinen Sirpa (varapj), mielenterveyshoitaja, kriisityöntekijä, ryhmä- ja työnohjaaja
Kilpikoski Sinikka, toimitusjohtaja, terveystieteiden tohtori, fysioterapeutti, ft-opettaja, Cert. ja Dip. MDT
Kyläkangas Olli, järjestöaktiivi
Kämppi Leena, fysioterapeutti
Nikkola Jan-Erik, järjestöaktiivi
Ranta Aino, järjestöaktiivi
Rantavalli Kari
, lehtori, DI
Tarna Leila, järjestöaktiivi